穆罕默德三世（Muhammet Han III，？－1211年），东喀喇汗国第十一代汗，玉素甫的儿子。他的祖父伊卜拉欣二世被西辽耶律大石赐予土库曼伊利克的称号。东喀喇汗国属于西辽的附庸。1205年，他的父亲玉素甫死在喀什噶尔，穆罕默德即位。因为密谋反叛西辽，穆罕默德被西辽皇帝耶律直鲁古囚禁。屈出律取代耶律直鲁古之后，释放穆罕默德，但是他不受贵族们的欢迎，在入城时，穆罕默德被杀死在喀什噶尔城门中，东喀喇汗国灭亡。
